甜菜碱可作为改善肠道健康的饲料添加剂，而热应激等不利因素会导致动物肠道弹性变差。当环境温度升高时，血液会优先流向皮肤以利于散热。这会导致流向胃肠道的血液削减，这反过来又会影响消化以及降低营养的消化率。

应激会导致生长猪肠道结构改变，假如不加以操控的话，进而会降低肠道的缩短能力。甜菜碱对动物的肠道结构和免疫系统会产生有益的效果。其对维持动物肠道完整性的有利效果能够保护动物免受与球虫病或肠道内其他不良微生物增殖引发的脱水环境，而脱水可能会损害动物的出产功能。较高猪肠道耐性产生的另一个有利效果是，在屠宰加工去除肠道过程中能够尽可能削减肠道的决裂以及由决裂引发的肠道食糜污染胴体的可能性。

在初产母猪上的研究发现，甜菜碱可以提高21日龄断奶仔猪数和断奶窝重，缩短了断奶后7d内发情间隔，改善繁殖性能；还可促进母猪排卵和卵母细胞成熟；因为甜菜碱作为甲基供体，可通过促进蛋白质合成，降低母猪血清中同型半胱氨酸水平，从而促进胚胎生长发育，改善母猪繁殖性能。

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